Хромосомный микроматричный анализ (ХМА)

Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) исследует ДНК, выделенную из клеток крови ребёнка, и оценивает количество генетического материала одновременно по всем хромосомам. Объектом анализа являются вариации числа копий: микроделеции (утрата участка хромосомы) и микродупликации (его удвоение). Такие перестройки меняют дозу десятков или сотен генов, среди которых нередко оказываются гены, управляющие развитием головного мозга. Большинство клинически значимых микроделеций и микродупликаций слишком малы, чтобы их можно было увидеть при стандартном кариотипировании: ХМА обнаруживает изменения в сотни раз мельче, охватывая при этом весь геном, поэтому не требует заранее предполагать, какой именно участок хромосомы затронут.

Международные согласительные документы рассматривают ХМА как генетическое исследование первой линии у детей с задержкой психомоторного и речевого развития, умственной отсталостью, расстройствами аутистического спектра и множественными врождёнными аномалиями. У таких пациентов патогенные вариации числа копий выявляются примерно в 15–20% случаев, что в несколько раз превышает информативность классического кариотипа. Обнаружение известного микроделеционного или микродупликационного синдрома завершает длительный диагностический поиск: становится понятной причина нарушений, появляется возможность оценить ожидаемое течение, сопутствующие риски (пороки сердца, почек, эндокринные нарушения) и вероятность повторения в семье. ХМА информативен и при эпилепсиях детского возраста, особенно при эпилептических энцефалопатиях с ранним началом и при сочетании судорог с отставанием развития: часть таких форм обусловлена хромосомными микроперестройками, и их выявление уточняет диагноз и прогноз.

Каждая найденная перестройка классифицируется по клинической значимости: патогенная, вероятно патогенная, доброкачественная или вариант с неопределённым значением. Варианты неопределённого значения встречаются нередко, и для их трактовки существенно, возникло ли изменение заново или унаследовано от здорового родителя, поэтому в заключении такие находки сопоставляются с клинической картиной и семейными данными. Метод оценивает только количество генетического материала: сбалансированные транслокации, точковые мутации в отдельных генах, экспансии повторов и низкоуровневый мозаицизм находятся за пределами его разрешения. Нормальный результат исключает клинически значимые вариации числа копий, и при сохраняющемся подозрении на наследственную природу нарушений поиск причины продолжается другими генетическими методами.