Посев мочи на микрофлору и определение чувствительности к антибиотикам и бактериофагам

Посев мочи на микрофлору с определением чувствительности к антибиотикам и бактериофагам представляет собой культуральное исследование, которое выявляет жизнеспособные бактерии и дрожжеподобные грибы, определяет вид выросших микроорганизмов и их количество в колониеобразующих единицах на миллилитр мочи (КОЕ/мл). Для бактерий, рост которых имеет диагностическое значение, дополнительно исследуют чувствительность к антибактериальным препаратам и бактериофагам. Анализ используют для установления бактериальной причины инфекции мочевыводящих путей, количественной оценки бактериурии и получения данных о препаратах и бактериофагах, активных против выделенной культуры. Антибиотикограмма показывает чувствительность конкретного бактериального штамма к исследованным антимикробным препаратам. Бактерии одного вида различаются механизмами устойчивости, поэтому название возбудителя не позволяет заранее определить эффективный антибиотик. Чувствительность к бактериофагам также устанавливают для конкретного выделенного штамма: бактериофаги инфицируют восприимчивые бактериальные клетки и вызывают их разрушение, а результат показывает, какие из протестированных фагов активны против обнаруженной бактерии. Эти данные относятся только к исследованной культуре и к препаратам, включённым в тестирование. Для данного исследования антибиотикограмма выполняется при росте микроорганизмов в количестве 10⁴ КОЕ/мл и более . При выявлении нормальной или сопутствующей микрофлоры, а также условно-патогенных бактерий в количестве менее 10⁴ КОЕ/мл, не имеющем диагностического значения по лабораторным критериям, чувствительность к антибиотикам и бактериофагам не определяется. Количество бактериального роста интерпретируют вместе с видом микроорганизма, способом получения мочи и клинической картиной, поскольку одинаковая концентрация бактерий имеет разное значение при симптомной инфекции, бессимптомной бактериурии и загрязнении образца во время сбора.

Выделяемые микроорганизмы и возбудители

• энтеробактерии: Escherichia coli, Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp., Salmonella spp. и другие представители группы;
• стрептококки;
• энтерококки;
• стафилококки, включая Staphylococcus aureus и Staphylococcus saprophyticus ;
• неферментирующие грамотрицательные бактерии, включая Pseudomonas spp. и Acinetobacter spp. ;
• дрожжеподобные грибы, которые выявляются скринингово по факту культурального роста.

Основные уропатогены и особенности их интерпретации

Escherichia coli является ведущим возбудителем внебольничных инфекций мочевыводящих путей. Staphylococcus saprophyticus также относится к установленным уропатогенам и наиболее характерен для острого цистита у молодых женщин. Klebsiella spp., Proteus spp., Enterobacter spp., Pseudomonas spp., Enterococcus spp. и другие бактерии из исследуемого спектра также вызывают инфекции мочевых путей. Для Proteus spp. характерно образование уреазы, способствующее ощелачиванию мочи и формированию инфекционных камней, поэтому стойкое выявление этих бактерий сочетается с повышенной вероятностью мочекаменной болезни. 
Рост Staphylococcus aureus , стрептококков, Acinetobacter spp. и других менее типичных для внебольничного цистита микроорганизмов требует сопоставления с количеством бактерий, способом получения мочи и состоянием пациента. Такой результат имеет разный диагностический смысл в правильно собранной средней порции мочи, катетерном образце и материале, полученном непосредственно из мочевого пузыря.

Клиническое значение

При симптомной инфекции мочевыводящих путей посев устанавливает бактериального возбудителя и количественно оценивает его рост. Цистит проявляется болезненным и учащённым мочеиспусканием, императивными позывами и болью или дискомфортом над лоном. При системной инфекции мочевых путей появляются лихорадка, озноб, боль в поясничной области, тошнота и выраженное недомогание. Для свободно собранной средней порции мочи ≥10⁵ КОЕ/мл остаётся классическим ориентиром выраженной бактериурии, однако у пациента с характерными симптомами диагностическое значение имеет и меньший чистый рост типичного уропатогена. При типичной картине острого неосложнённого цистита у женщины диагноз часто устанавливают клинически; посев особенно необходим при системной инфекции, беременности, атипичных проявлениях, отсутствии эффекта лечения и раннем возврате симптомов. 
При рецидивирующей инфекции, сохранении симптомов после лечения и повышенной вероятности антибиотикорезистентности исследование определяет возбудителя текущего эпизода и его чувствительность к препаратам. Рецидивирующий цистит определяется как три и более эпизода в течение года либо два и более за шесть месяцев. Предшествующая антибактериальная терапия способствует отбору устойчивой бактериальной популяции, поэтому при повторном заболевании результат прежней антибиотикограммы не заменяет исследование вновь выделенной культуры. Одинаковый вид бактерии в последовательных посевах также не доказывает сохранение одного и того же штамма, поскольку стандартный посев не выполняет его генетическое типирование. При планировании фаготерапии результат дополнительно показывает, какие из протестированных бактериофагов активны против выделенной бактерии. Рутинный контрольный посев после успешного лечения при полном исчезновении симптомов не требуется; повторное исследование проводят при сохранении или быстром возвращении клинических проявлений. 
При бессимптомной бактериурии бактерии обнаруживаются в моче при отсутствии симптомов инфекции мочевыводящих путей. Для женщин классическим диагностическим критерием служит рост одного и того же микроорганизма ≥10⁵ КОЕ/мл в двух последовательно полученных образцах средней порции мочи, для мужчин достаточно одного образца с таким уровнем бактериурии. У большинства пациентов бессимптомная бактериурия не требует антибактериального лечения. Скрининг и лечение показаны прежде всего при беременности и перед эндоскопическими урологическими вмешательствами, сопровождающимися повреждением слизистой мочевых путей. 
При смешанном или небольшом бактериальном росте результат оценивают с учётом способа получения материала. Одновременное выделение нескольких видов без преобладания типичного уропатогена из свободно собранной средней порции мочи чаще связано с загрязнением образца микрофлорой наружных половых органов и дистального отдела уретры. При мочевом катетере или структурных нарушениях мочевых путей смешанный рост не следует автоматически относить к контаминации. Если результат не согласуется с клинической картиной и характер роста указывает на загрязнение, исследование повторяют из правильно собранной мочи. Отрицательный стандартный посев также не исключает инфекцию, вызванную вирусами, хламидиями, микоплазмами и микроорганизмами, требующими специальных условий культивирования, поскольку они не входят в диагностический спектр этой услуги.

Что влияет на результат

Антибактериальные препараты подавляют чувствительные бактерии и уменьшают количество жизнеспособных микроорганизмов в моче. После начала лечения культуральный рост снижается или отсутствует, поэтому материал для первичного посева получают до начала антибиотикотерапии, если это не задерживает необходимое лечение. Нарушение техники сбора средней порции мочи приводит к попаданию в образец бактерий кожи, наружных половых органов и дистального отдела уретры. Такая контаминация вызывает смешанный рост и затрудняет оценку истинной бактериурии. Длительное хранение мочи при комнатной температуре приводит к размножению присутствующих бактерий и искусственному увеличению КОЕ/мл.