ПЦР типирование ВПЧ: 6,11,16,18,26,31,33,35,42,44,51-54,58,59 типы в урогенитальном соскобе

Анализ предназначен для качественного выявления ДНК вируса папилломы человека с раздельной идентификацией 16 генотипов методом ПЦР. В панель входят генотипы низкого канцерогенного риска 6, 11, 42, 44 и 54; генотипы установленного высокого канцерогенного риска 16, 18, 31, 33, 35, 51, 52, 58 и 59; а также генотипы 26 и 53 с менее определённым онкогенным потенциалом. Результат выдаётся отдельно по каждому генотипу в формате «обнаружено» или «не обнаружено». Биоматериалом служит соскоб эпителиальных клеток из цервикального канала, влагалища или уретры; место взятия материала определяется клинической задачей.
Особенность панели — раздельное типирование каждого из 16 включённых генотипов, в отличие от исследований, выдающих суммарный результат по группе типов. Такой формат позволяет определить, какие именно генотипы из состава панели обнаружены в образце, и выявить сочетание нескольких типов ВПЧ. Исследование не определяет вирусную нагрузку и не выявляет генотипы, отсутствующие в составе панели.

ВПЧ — обширная группа ДНК-содержащих вирусов, поражающих эпителий кожи и слизистых оболочек. Из более чем двухсот известных генотипов клинически значимая часть делится по их онкогенному потенциалу. Генотипы высокого канцерогенного риска связаны с развитием рака шейки матки, анального рака, рака других локализаций аногенитальной области и рака ротоглотки. Генотипы низкого риска вызывают доброкачественные пролиферативные поражения — аногенитальные кондиломы. Между этими группами выделяется ряд типов с возможным или менее доказанным онкогенным потенциалом, не относящихся ни к определённо высокому, ни к низкому риску. 
В составе панели пять генотипов низкого риска. ВПЧ 6 и ВПЧ 11 — два главных возбудителя аногенитальных кондилом, ответственные за подавляющее большинство случаев. ВПЧ 42, ВПЧ 44 и ВПЧ 54 — реже встречающиеся представители низкого риска, расширяющие охват возможных возбудителей доброкачественных поражений. 
Девять генотипов высокого риска включают ведущие онкогенные типы (16, 18) и расширенный перечень дополнительных типов (31, 33, 35, 51, 52, 58, 59). ВПЧ 16 и ВПЧ 18 обладают наиболее высоким канцерогенным потенциалом и вместе ассоциированы приблизительно с 70% случаев рака шейки матки в мире. Другие включённые в панель генотипы высокого риска также причинно связаны с цервикальными предраковыми изменениями и раком, однако их индивидуальный вклад различается.
Два генотипа — ВПЧ 26 и ВПЧ 53 — относятся к группе с возможным онкогенным потенциалом. Их связь с предраковыми изменениями и раком шейки матки доказана слабее, чем у генотипов установленного высокого риска, и в современных классификациях они относятся к группе «возможно канцерогенных». Раздельное выявление этих типов предоставляет дополнительную информацию об их присутствии в образце, однако клиническое значение результата отличается от значения обнаружения генотипов с установленным высоким канцерогенным риском.
Развёрнутый формат с типированием каждого генотипа применяется в ситуациях, когда детальная характеристика этиологии инфекции имеет практическое значение. Это может быть индивидуальная оценка пациенток с длительно сохраняющейся ВПЧ-инфекцией или с рецидивирующими предраковыми изменениями шейки матки; обследование пациенток с сочетанной картиной — одновременным присутствием поражений, ассоциированных и с высоким, и с низким риском; научно-клинические задачи изучения генотипического спектра инфекции.

При этом для рутинного цервикального скрининга развёрнутое типирование на шестнадцать генотипов не является стандартным инструментом. Стандартизованные программы скрининга используют суммарный тест на четырнадцать генотипов высокого риска или тесты с раздельным выявлением только ВПЧ 16, 18 и других высокого риска; включение в панель генотипов низкого риска и расширенного перечня обосновано в специфических задачах, выходящих за рамки обычного скрининга.

Метод ПЦР выявляет генотипоспецифические участки генома каждого из шестнадцати включённых типов, обеспечивая их раздельную идентификацию. Метод не зависит от жизнеспособности вируса и обладает высокой аналитической чувствительностью при низком содержании вирусной ДНК в пробе.

Клиническое значение

Исследование определяет наличие ДНК каждого из 16 генотипов ВПЧ, включённых в панель. Раздельный результат позволяет выявить моноинфекцию одним генотипом или сочетанное присутствие нескольких типов вируса. Обнаружение генотипа высокого канцерогенного риска указывает на наличие соответствующего типа ВПЧ в исследованном образце, но не подтверждает наличие дисплазии или рака. Клиническая тактика определяется врачом с учётом возраста пациентки, результатов валидированного теста высокого канцерогенного риска, цитологического исследования, кольпоскопии и предшествующего анамнеза. Обнаружение ВПЧ 6, 11, 42, 44 или 54 подтверждает присутствие соответствующего генотипа в исследованном образце, но не устанавливает причину конкретного образования и не подтверждает диагноз аногенитальных кондилом. Диагноз кондилом обычно устанавливают при клиническом осмотре; при атипичных образованиях может потребоваться биопсия.
Отрицательный результат означает, что ДНК 16 включённых в панель генотипов не обнаружена в исследованном образце. Он не исключает наличие других типов ВПЧ и не должен интерпретироваться как отрицательный результат полноценного скринингового теста на весь клинически значимый спектр ВПЧ высокого канцерогенного риска.

Что влияет на результат

На результат исследования влияет количество вирусной ДНК в исследуемом участке слизистой. При низкой концентрации ВПЧ результат может быть отрицательным, даже если вирус присутствует в количестве ниже аналитической чувствительности метода. ВПЧ может присутствовать неравномерно в разных отделах урогенитального тракта, поэтому результат характеризует только участок, из которого получен соскоб. Обнаружение или отсутствие вируса в материале из влагалища, цервикального канала или уретры не всегда отражает его наличие в других анатомических локализациях. Результаты исследований, выполненных в разные периоды, могут различаться. Большинство ВПЧ-инфекций со временем становится неопределяемым вследствие иммунного ответа, тогда как персистирующая инфекция сохраняется и может выявляться повторно. Панель выявляет только 16 заявленных генотипов. Отрицательный результат не исключает наличие других типов ВПЧ, не входящих в состав исследования, в том числе отдельных генотипов высокого канцерогенного риска. Положительный результат подтверждает наличие ДНК соответствующего генотипа в исследованном образце, но не определяет активность инфекции и не подтверждает наличие дисплазии или злокачественного процесса. Клиническую оценку проводят с учётом результатов цитологического исследования, кольпоскопии и других обследований.