ПЦР типирование ВПЧ: 6,11,16,18,26,31,33,35,42,44,51-54,58,59 типы в урогенитальном соскобе

Анализ выявляет ДНК вируса папилломы человека (ВПЧ) с раздельной идентификацией шестнадцати генотипов в соскобе со слизистой урогенитального тракта методом ПЦР. Состав панели включает генотипы низкого канцерогенного риска (6, 11, 42, 44, 54), генотипы высокого канцерогенного риска (16, 18, 31, 33, 35, 51, 52, 58, 59) и генотипы с возможным онкогенным потенциалом (26, 53) — три клинически различающиеся группы возбудителей в одной развёрнутой панели. Результат выдаётся раздельно по каждому из шестнадцати генотипов в формате обнаружено / не обнаружено. Биоматериал — соскоб со слизистой урогенитального тракта: у женщин соскоб из цервикального канала или с поверхности шейки матки (зоны трансформации), у мужчин — соскоб из уретры.

Особенность панели — её развёрнутый формат с раздельным типированием каждого выявленного генотипа, в отличие от скрининговых панелей с суммарным ответом по группе. Этот формат даёт более детальную этиологическую картину инфекции и применяется в специфических ситуациях, когда такая детализация имеет клиническое значение.

ВПЧ — обширная группа ДНК-содержащих вирусов, поражающих эпителий кожи и слизистых оболочек. Из более чем двухсот известных генотипов клинически значимая часть делится по их онкогенному потенциалу. Генотипы высокого канцерогенного риска связаны с развитием рака шейки матки, анального рака, рака других локализаций аногенитальной области и рака ротоглотки. Генотипы низкого риска вызывают доброкачественные пролиферативные поражения — аногенитальные кондиломы. Между этими группами выделяется ряд типов с возможным или менее доказанным онкогенным потенциалом, не относящихся ни к определённо высокому, ни к низкому риску. 
В составе панели пять генотипов низкого риска. ВПЧ 6 и ВПЧ 11 — два главных возбудителя аногенитальных кондилом, ответственные за подавляющее большинство случаев. ВПЧ 42, ВПЧ 44 и ВПЧ 54 — реже встречающиеся представители низкого риска, расширяющие охват возможных возбудителей доброкачественных поражений. 
Девять генотипов высокого риска включают ведущие онкогенные типы (16, 18) и расширенный перечень дополнительных типов (31, 33, 35, 51, 52, 58, 59). ВПЧ 16 и ВПЧ 18 ответственны за подавляющее большинство случаев рака шейки матки. Остальные включённые в панель типы высокого риска причинно ассоциированы с цервикальной онкологической патологией с разной частотой и относятся к группе с установленным онкогенным потенциалом по международным классификациям. 
Два генотипа — ВПЧ 26 и ВПЧ 53 — относятся к группе с возможным онкогенным потенциалом. Их связь с предраковыми изменениями и раком шейки матки доказана слабее, чем у генотипов установленного высокого риска, и в современных классификациях они относятся к группе «возможно канцерогенных». Раздельное выявление этих типов в развёрнутой панели даёт более полную этиологическую картину, но клиническая интерпретация их обнаружения отличается от интерпретации генотипов с установленным онкогенным потенциалом. 
Развёрнутый формат с типированием каждого генотипа применяется в ситуациях, когда детальная характеристика этиологии инфекции имеет практическое значение. Это может быть индивидуальная оценка пациенток с длительно сохраняющейся ВПЧ-инфекцией или с рецидивирующими предраковыми изменениями шейки матки; обследование пациенток с сочетанной картиной — одновременным присутствием поражений, ассоциированных и с высоким, и с низким риском; научно-клинические задачи изучения генотипического спектра инфекции.

При этом для рутинного цервикального скрининга развёрнутое типирование на шестнадцать генотипов не является стандартным инструментом. Стандартизованные программы скрининга используют суммарный тест на четырнадцать генотипов высокого риска или тесты с раздельным выявлением только ВПЧ 16, 18 и других высокого риска; включение в панель генотипов низкого риска и расширенного перечня обосновано в специфических задачах, выходящих за рамки обычного скрининга.

Метод ПЦР выявляет генотипоспецифические участки генома каждого из шестнадцати включённых типов, обеспечивая их раздельную идентификацию. Метод не зависит от жизнеспособности вируса и обладает высокой аналитической чувствительностью при низком содержании вирусной ДНК в пробе.

Клиническое значение

Применение теста определяется задачей детальной этиологической характеристики ВПЧ-инфекции урогенитального тракта в ситуациях, где такая детализация имеет практическую ценность.

Тест применяется при индивидуальной оценке пациенток с длительно сохраняющейся ВПЧ-инфекцией, когда лечащий врач хочет получить полную картину генотипического состава инфекции; при обследовании пациенток с рецидивирующими предраковыми изменениями шейки матки, у которых требуется детальный этиологический анализ; при обследовании пациенток с сочетанной картиной — одновременным присутствием аногенитальных кондилом и подозрительных цервикальных изменений, — когда полезно выявить и возбудителей низкого риска, и возбудителей высокого риска в одном исследовании.

Положительный результат на любой из включённых в панель генотипов подтверждает присутствие соответствующего типа ВПЧ в пробе. Тактика после положительного результата определяется лечащим врачом с учётом того, какие именно генотипы выявлены и в какой клинической ситуации проводится обследование. Обнаружение ВПЧ 16 и ВПЧ 18 имеет наибольший клинический вес в контексте цервикального онкогенного риска. Обнаружение других генотипов высокого риска учитывается в общей оценке риска. Обнаружение ВПЧ 6 и ВПЧ 11 указывает на возможный этиологический фактор кондилом при наличии соответствующей клинической картины. Обнаружение генотипов с возможным онкогенным потенциалом (26, 53) учитывается в общей этиологической картине, но клинический вес их находки меньше, чем у генотипов установленного высокого риска. Сам по себе положительный результат не равнозначен диагнозу предраковых изменений или рака шейки матки — установление этих диагнозов требует цитологического, кольпоскопического и при необходимости морфологического исследования.

Отрицательный результат по всем шестнадцати генотипам у женщины снижает вероятность участия включённых в панель типов ВПЧ в клинической картине. Отрицательный результат не исключает присутствия более редких генотипов, не входящих в панель.

Ограничения

Метод ПЦР выявляет ДНК возбудителя и не говорит о его жизнеспособности. Панель охватывает шестнадцать конкретных генотипов; другие типы ВПЧ — высокого риска (39, 45, 56, 66, 68) и более редкие низкого риска (43 и другие) — данным исследованием не выявляются. Развёрнутый формат панели не является стандартным инструментом цервикального скрининга: для скрининга используются другие форматы тестов. Молекулярное обнаружение ВПЧ само по себе не равнозначно диагнозу предраковых изменений или рака шейки матки: установление этих диагнозов требует морфологического исследования биопсийного материала. Положительный результат — фактор для индивидуальной оценки врачом, не самостоятельный диагноз. Качественный формат теста не даёт количественной оценки содержания вирусной ДНК в пробе. Включённые в панель ВПЧ 26 и ВПЧ 53 относятся к группе с менее доказанным онкогенным потенциалом; интерпретация их обнаружения отличается от интерпретации генотипов установленного высокого риска. Качество забора материала имеет существенное значение: у женщин адекватный соскоб должен включать клетки из зоны трансформации шейки матки; неоптимальный забор снижает чувствительность исследования. Применение теста у мужчин ограничено: стандартизованного скрининга ВПЧ-инфекции у мужчин в международной практике не сложилось, а тестирование партнёров инфицированных женщин в современных рекомендациях не предусмотрено. Результат исследования требует интерпретации врачом — гинекологом, дерматовенерологом, онкологом — с учётом клинической картины, результатов цитологического и кольпоскопического исследования у женщин, общей ситуации.