Определение распространенных мутаций генов BRCA1, BRCA2 при раке молочной железы и яичников в биопсийном материале

Рак молочной железы и рак яичников относятся к самым частым злокачественным опухолям у женщин. Большинство случаев возникают спорадически, однако заметная часть имеет наследственную природу. Основная наследственная форма — наследственный синдром рака молочной железы и яичников: передающаяся в семье предрасположенность, при которой риск этих опухолей резко повышен и связан с мутациями генов-супрессоров BRCA1 и BRCA2. Для BRCA-ассоциированных опухолей характерны более молодой возраст возникновения, нередко двустороннее поражение, сочетание рака молочной железы и рака яичников у одного человека или в одной семье и накопление подобных случаев среди близких родственников. Гены BRCA1 и BRCA2 в норме помогают клетке восстанавливать повреждения ДНК и сдерживают её бесконтрольное деление, то есть защищают от опухолевого роста. Если ген повреждён мутацией и его функция утрачена, эта защита ослабевает, и со временем повышается вероятность злокачественного перерождения клетки. 
Данное исследование определяет распространённые (частые) патогенные мутации генов BRCA1 и BRCA2 в опухолевой ткани — биопсийном или операционном материале. В отличие от анализа крови, который оценивает наследственные варианты во всех клетках организма, здесь исследуется ткань уже существующей опухоли, и результат характеризует прежде всего саму опухоль. Материалом служит фрагмент опухоли, полученный при биопсии или операции, поэтому исследование выполнимо и тогда, когда доступен только опухолевый материал, а образец крови получить нельзя. 
Мутации BRCA в опухоли бывают двух типов: герминальные (наследуемые), присутствующие во всех клетках организма, и соматические, возникшие только в опухолевой ткани. Эта панель ориентирована на распространённые в российской и восточноевропейской популяции founder-варианты BRCA1 и BRCA2 — частые, повторяющиеся мутации, которые по своей природе наследуемые. Она целенаправленно выявляет эти конкретные, заранее известные варианты, а не прочитывает всю последовательность генов, поэтому охватывает частые наследственные мутации, но не разнообразные соматические и редкие варианты. Результат выдаётся раздельно по каждому гену, с указанием конкретной выявленной мутации (например, 4153delA в гене BRCA1 или 6174delT в гене BRCA2).

Состав исследования

Исследование охватывает распространённые патогенные варианты генов BRCA1 и BRCA2, характерные для российской и восточноевропейской популяции. В гене BRCA1: 185delAG, 4153delA, 5382insC, 3819delGTAAA, 3875delGTCT, 300T>G (Cys61Gly), 2080delA, c.5251C>T, c.5161C>T, c.4675G>A, c.4689C>G. В гене BRCA2: 6174delT, c.3749dupA, c.961_962insAA, c.2897_2898del, c.8754+1G>A. Результат выдаётся раздельно по каждому гену.

Клиническое значение

Положительный результат означает, что в опухолевой ткани обнаружена одна из частых патогенных мутаций гена BRCA1 или BRCA2, то есть опухоль относится к BRCA-ассоциированным. Это имеет двоякое значение. Во-первых, такие опухоли, как правило, более чувствительны к препаратам платины и к ингибиторам PARP, поэтому результат может учитываться при планировании лечения, в том числе при выборе поддерживающей терапии при раке яичников. Во-вторых, поскольку выявленные варианты относятся к частым наследственным мутациям, их обнаружение в опухоли с высокой вероятностью отражает наследуемое (герминальное) носительство.

Поэтому положительный результат служит основанием для подтверждающего исследования крови: само по себе исследование опухоли не позволяет однозначно отличить наследственную мутацию от приобретённой, а анализ крови подтверждает герминальное носительство. При подтверждении оценивают наследственный риск для самого пациента и его кровных родственников. При этом спектр наследственного риска зависит от затронутого гена: при мутации BRCA1 относительно выше риск рака яичников, а мутации BRCA2 связаны с более широким спектром опухолей, включая рак предстательной и поджелудочной железы. Близким родственникам может быть предложено целенаправленное тестирование на тот же вариант (каскадный скрининг), поскольку каждый из них может оказаться носителем с вероятностью 50%.

Отрицательный результат означает, что распространённых мутаций в исследованных генах не обнаружено. Его важно трактовать осторожно: отсутствие частых мутаций не исключает участия BRCA в развитии опухоли, поскольку соматические мутации и редкие наследственные варианты данной панелью не выявляются. Поэтому при отрицательном результате, но сохраняющейся необходимости определить BRCA-статус опухоли, в том числе для решения о терапии, проводят секвенирование всей кодирующей области генов BRCA1 и BRCA2.

Что влияет на результат анализа

Исследование выявляет только распространённые (частые) мутации генов BRCA1 и BRCA2 и по своему устройству не рассчитано на поиск редких и соматических вариантов. Это задаёт границы трактовки: положительный результат достоверно подтверждает наличие частой мутации, а отрицательный сужает вероятность, но не снимает вопрос о BRCA-ассоциированной природе опухоли. На достоверность результата влияет качество исследуемого материала: содержание опухолевых клеток в образце, объём и сохранность ткани, правильность её фиксации и обработки. Если опухолевых клеток в образце мало или ткань значительно изменена, результат может оказаться неинформативным и потребовать повторного забора материала. Поэтому для исследования важно предоставить репрезентативный образец опухоли в надлежащем состоянии. Результат интерпретируют не изолированно, а вместе с клиническими данными, типом и стадией опухоли. Решение о тактике лечения и дальнейшем обследовании принимает лечащий врач совместно с онкологом и, при необходимости, с врачом-генетиком.