Для врача 
Определение мутации в гене POLE
Информация об исследовании
Определение мутации в гене POLE выявляет генетический вариант в гене, который кодирует каталитическую субъединицу ДНК-полимеразы эпсилон. Этот фермент участвует в копировании ДНК и поддержании точности репликации. Наибольшую клиническую значимость имеют патогенные варианты корректирующего, экзонуклеазного, домена POLE, поскольку они нарушают исправление ошибок репликации и могут приводить к накоплению большого числа точечных мутаций в опухоли.
Главная клиническая роль исследования POLE связана с разграничением клинически значимых и нейтральных вариантов гена. Для опухолевой классификации важен не сам факт любой замены в POLE, а доказанная связь варианта с нарушением корректирующей функции ДНК-полимеразы эпсилон. Патогенные варианты корректирующего домена формируют полимераз-корректурный механизм опухолевого развития: синтез ДНК сохраняется, но ошибки репликации накапливаются, и опухоль приобретает ультрамутированный фенотип.
Клиническое значение
При раке эндометрия патогенные варианты корректирующего домена POLE используются в молекулярной классификации опухоли. POLE-мутированный подтип выделяют наряду с опухолями с нарушением репарации неспаренных оснований, p53-аномальным типом и опухолями без специфического молекулярного профиля. Такой результат приобретает клинический смысл в связке с морфологическим типом опухоли, степенью дифференцировки, глубиной инвазии, лимфоваскулярной инвазией, p53-профилем и состоянием системы репарации неспаренных оснований. Отдельная находка p.A245D без указания патогенности и опухолевого профиля не заменяет эту молекулярную классификацию.
В колоректальных опухолях POLE оценивают как возможный маркер полимераз-корректурного пути канцерогенеза. Клиническая значимость усиливается при раннем колоректальном раке, множественных аденоматозных полипах, сочетании колоректальной опухоли с раком эндометрия или семейном накоплении опухолей. В этой линии результат сопоставляют с синдромом Линча, семейным аденоматозным полипозом, MUTYH-ассоциированным полипозом и другими наследственными синдромами опухолевой предрасположенности.
Наследственный вариант POLE связан с врождённой опухолевой предрасположенностью, если он имеет доказанную патогенность и присутствует конституционально. Такой контекст рассматривают при множественных аденомах, раннем колоректальном раке, опухолях эндометрия, двенадцатиперстной кишки, яичников, центральной нервной системы и повторяющихся онкологических заболеваниях у родственников. Соматическая находка в опухоли, напротив, описывает молекулярные свойства конкретного новообразования. Поэтому происхождение варианта меняет клиническую задачу результата.
Вариант p.A245D требует отдельной оценки, поскольку аминокислотная запись не сообщает его патогенность. Для такой находки важно, отнесён ли вариант к патогенным, вероятно патогенным, доброкачественным, вероятно доброкачественным или вариантам неопределённого клинического значения. При отсутствии этой классификации результат остаётся указанием на обнаруженную замену в POLE, а его клинический вес определяется дополнительными данными: типом опухоли, семейным анамнезом, молекулярным профилем, мутационной нагрузкой, мутационной сигнатурой и данными о влиянии варианта на функцию белка.
Что влияет на интерпретацию результата
На трактовку POLE влияет происхождение варианта. Соматическая мутация характеризует конкретную опухоль и используется для её молекулярной оценки. Наследственный вариант отражает врождённую предрасположенность и приобретает значение при раннем начале заболевания, множественных полипах, сочетании нескольких опухолей у одного пациента или повторяющихся онкологических заболеваниях у родственников. Расположение варианта определяет его клинический вес. Патогенные изменения корректирующего домена имеют наиболее тесную связь с нарушением точности репликации и ультрамутированным опухолевым фенотипом. Варианты вне этого домена или изменения без доказанного влияния на функцию белка оценивают по совокупности клинических и молекулярных данных. Классификация варианта является центральной для результата. Клиническую нагрузку несут патогенные и вероятно патогенные варианты. Варианты неопределённого клинического значения требуют сопоставления с типом опухоли, морфологией, семейным анамнезом, статусом p53, системой репарации неспаренных оснований, микросателлитной нестабильностью, мутационной нагрузкой и мутационной сигнатурой. Тип опухоли задаёт клиническую рамку результата. При раке эндометрия POLE рассматривают в составе молекулярной классификации. При колоректальном раке и множественных аденомах результат оценивают через связь с полимераз-корректурным полипозом и другими наследственными синдромами. При иной опухолевой локализации значение варианта определяется конкретной клинической задачей и молекулярным окружением опухоли.
Когда назначают анализ
- Молекулярная классификация эндометриальной карциномы для выявления опухолей с патогенными мутациями в экзонуклеазном домене POLE, которые относят к группе с благоприятным прогнозом.
- Уточнение прогноза при раке эндометрия ранних стадий, когда результат влияет на оценку риска рецидива и сопоставляется с гистологическими и клиническими данными при выборе тактики.
- Стратификация риска у пациенток с эндометриоидной карциномой высокой степени злокачественности, где выявление мутации POLE меняет прогностическую группу в сторону более благоприятной.
- Обследование при колоректальном раке с гипермутабельным фенотипом для уточнения молекулярного механизма гипермутации и характеристики опухоли.
- Может рассматриваться при опухолях с признаками ультрамутабельности по данным определения мутационной нагрузки для выявления возможного дефекта корректирующей функции POLE, при отсутствии других установленных причин.
- Может рассматриваться при наследственных формах колоректального полипоза без выявленных мутаций в типичных генах для оценки вклада зародышевых вариантов POLE, как дополнительное исследование.
- Может рассматриваться при оценке потенциального ответа на иммунотерапию у опухолей с высокой мутационной нагрузкой, поскольку дефект POLE сопровождается выраженным накоплением мутаций, при сопоставлении с другими молекулярными маркерами.
Как подготовиться к анализу
Общие требования:
- Специальной подготовки для данного исследования не требуется. Результат генотипирования не зависит от приёма пищи, времени суток, физической нагрузки, курения, приёма алкоголя и лекарственных препаратов.
- Накануне вечером рекомендуется лёгкий нежирный ужин: жирная пища может приводить к хилёзу образца. Утром перед забором допустима негазированная вода.
- Если в течение последних 3 месяцев проводились переливания компонентов крови, трансплантация костного мозга или терапия стволовыми клетками, об этом следует сообщить медсестре и лечащему врачу до взятия образца: донорский генетический материал в циркуляции может повлиять на результат.
- О постоянно принимаемых препаратах следует предупредить медсестру. Отменять плановую терапию не требуется.
Исследование выявляет патогенные варианты в экзонуклеазном домене гена POLE, кодирующего каталитическую субъединицу ДНК-полимеразы эпсилон. Такие мутации нарушают корректирующую активность фермента и сопровождаются гипермутационным фенотипом опухоли. Молекулярно-генетический анализ применяется при характеристике рака эндометрия и колоректального рака, поскольку POLE-мутированный подтип ассоциирован с особым биологическим поведением опухоли и учитывается при молекулярной классификации новообразований.
Анализ применяется преимущественно при раке эндометрия и колоректальном раке для молекулярного субтипирования опухоли. Мутации в экзонуклеазном домене POLE формируют отдельную категорию в современной классификации карцином эндометрия наряду с микросателлитной нестабильностью, аномалиями p53 и группой без специфических молекулярных признаков. Тест также рассматривается при ультрамутированных опухолях иной локализации и при подозрении на наследственный полимеразо-ассоциированный полипоз, когда выявляются герминальные варианты гена.
Опухоли с патогенными вариантами POLE характеризуются ультравысокой мутационной нагрузкой из-за утраты корректирующей функции ДНК-полимеразы эпсилон. Такой фенотип совместим с выраженной иммуногенностью и плотной лимфоцитарной инфильтрацией. В когортах рака эндометрия POLE-мутированный подтип ассоциирован с благоприятным прогнозом независимо от гистологической степени. Биологические свойства этих опухолей учитываются при молекулярной стратификации и интерпретации сопутствующих маркёров — микросателлитной нестабильности и статуса p53.
Интерпретация молекулярного статуса POLE в контексте лечебной тактики относится к компетенции лечащего онколога и мультидисциплинарной команды. Решение опирается на гистологический тип и стадию опухоли, сопутствующие молекулярные маркёры, общее состояние пациента и действующие клинические рекомендации. Лабораторный результат сам по себе не служит самостоятельным критерием выбора терапии, а используется как один из компонентов комплексной молекулярной характеристики новообразования.
Варианты гена POLE могут быть как соматическими, выявляемыми только в опухолевой ткани, так и герминальными, присутствующими во всех клетках организма. Герминальные патогенные варианты ассоциированы с полимеразо-ассоциированным полипозом и наследственной предрасположенностью к колоректальному раку и опухолям эндометрия. Разграничение соматического и герминального происхождения мутации проводится при сопоставлении результатов исследования опухолевой ткани и образца нормальных клеток, что относится к области медико-генетического консультирования.
Для исследования соматических мутаций POLE применяется опухолевая ткань, чаще всего парафиновые блоки после гистологической верификации новообразования. При поиске герминальных вариантов используется венозная кровь или буккальный эпителий. Выбор биоматериала определяется клинической задачей: молекулярное субтипирование опухоли требует анализа опухолевого образца, тогда как оценка наследственной предрасположенности проводится по ДНК нормальных клеток пациента.
Стоимость исследования
биоматериала 0 ₽