ПЦР-диагностика стрептококка (Streptococcus spp.) в слюне

Анализ выявляет ДНК микроорганизмов рода Streptococcus в слюне методом ПЦР. Результат выдаётся на уровне рода в формате обнаружено / не обнаружено. Биоматериал — слюна, собираемая натощак в стерильную ёмкость. Клиническая специфика слюны как биоматериала для исследования на стрептококк определяется тем, что стрептококки разных видов составляют значительную часть нормальной микрофлоры полости рта и ротоглотки: их постоянное присутствие в слюне — обычное биологическое состояние, и интерпретация результата исследования выстраивается с учётом этого обстоятельства.

Род Streptococcus объединяет грамположительные кокки, клинически значимо представленные в микрофлоре человека. В полости рта и слюне доминируют стрептококки так называемой viridans-группы (S. mitis, S. sanguinis, S. oralis, S. salivarius, а также кариесогенные виды S. mutans и S. sobrinus) — комменсальные микроорганизмы, составляющие основу нормальной оральной микрофлоры у практически всех здоровых людей. Их количественное содержание в слюне значительно, и баланс оральной стрептококковой флоры имеет самостоятельное клиническое значение в стоматологической практике — прежде всего в контексте кариесогенной активности микрофлоры, связанной с S. mutans и родственными видами. 
Другие клинически значимые стрептококки — S. pyogenes (β-гемолитический стрептококк группы A, возбудитель стрептококкового фарингита и других инфекций), S. pneumoniae (ведущий возбудитель бактериальной пневмонии, способный бессимптомно колонизировать верхние дыхательные пути) — могут обнаруживаться в слюне как при бессимптомном носительстве, так и при инфекциях ротоглотки с вовлечением слюны. Для этиологической верификации этих инфекций существуют стандартные биоматериалы, отражающие их клинические очаги: при стрептококковом фарингите — мазок со слизистой задней стенки глотки и миндалин, при инфекциях нижних дыхательных путей — отделяемое нижних дыхательных путей, при бактериемии — кровь.

ПЦР выявляет специфические участки генома стрептококков — в тест-системах с родовым ответом это консервативные последовательности, общие для большинства видов рода. Метод не зависит от жизнеспособности микроорганизма и обеспечивает высокую аналитическую чувствительность. Родовой уровень ответа вместе с богатым стрептококковым фоном слюны определяет характер клинического применения теста.

Клиническое значение

Исследование применяется в клинических задачах, связанных с оценкой микробного фона полости рта и слюны. В стоматологической практике оно может быть частью комплексной оценки микрофлоры при хронических воспалительных процессах слизистой полости рта, при галитозе, при рецидивирующих инфекциях слизистой, при индивидуализированной оценке кариесогенной микрофлоры в рамках более широкого обследования. В педиатрической практике исследование слюны рассматривается как неинвазивный биоматериал в ситуациях, когда получение стандартных мазков затруднено у маленьких детей.

Клиническая роль теста формируется в сочетании с видовой идентификацией возбудителя и клиническим контекстом. Для прямой этиологической верификации стандартных стрептококковых инфекций — стрептококкового фарингита, инфекций нижних дыхательных путей, бактериемии — используются клинически соответствующие биоматериалы и видоспецифические исследования; родовой тест в слюне в этих клинических задачах не выступает первичным диагностическим инструментом.

Положительный результат подтверждает присутствие стрептококков в слюне. Для клинически осмысленной интерпретации находка требует видового уточнения и сопоставления с клинической картиной, поскольку родовой тест не различает комменсальные виды, составляющие нормальную микрофлору полости рта, и клинически значимые патогенные виды. В большинстве клинических ситуаций положительный результат отражает присутствие привычной стрептококковой оральной микрофлоры; при клиническом подозрении на конкретную стрептококковую инфекцию диагностика продолжается видоспецифическим исследованием соответствующего биоматериала.

Отрицательный результат — относительно необычное биологическое событие для слюны, которое может отражать существенное изменение оральной микрофлоры, например после интенсивной системной или местной антимикробной терапии. В контексте стандартной клинической интерпретации этот результат обычно не имеет самостоятельного диагностического значения и оценивается в общей клинической ситуации.

Ограничения

Метод ПЦР выявляет ДНК возбудителя и не говорит о его жизнеспособности. Тест даёт ответ на уровне рода Streptococcus и не разграничивает отдельные виды, что в контексте слюны имеет особое значение: доминирующие в оральной микрофлоре стрептококки viridans-группы и клинически значимые патогенные виды (S. pyogenes, S. pneumoniae) родовым тестом не различаются. Для видовой идентификации при необходимости выполняется отдельное молекулярное исследование с видоспецифическими мишенями. Для этиологической верификации стандартных стрептококковых инфекций применяются клинически соответствующие биоматериалы и видоспецифические исследования; исследование слюны в этих задачах не выступает первичным инструментом и рассматривается преимущественно в стоматологическом контексте и в ситуациях невозможности получения стандартного биоматериала. На чувствительность метода влияет предшествующая системная или местная антибактериальная терапия, а также применение антисептических растворов для полоскания полости рта непосредственно перед забором материала. ПЦР не определяет чувствительность стрептококков к антибактериальным препаратам. Результат исследования требует интерпретации врачом — стоматологом, оториноларингологом, терапевтом — с учётом клинической картины, данных осмотра полости рта, результатов других исследований и общей клинической ситуации.