Онкогенетическое исследование при колоректальном раке: MSI, BRAF V600E, KRAS кодоны 12, 13, 61, 117, 146, NRAS кодоны 12, 13, 61, 117

Онкогенетическое исследование при колоректальном раке определяет микросателлитную нестабильность (MSI), мутацию BRAF V600E и мутации в клинически значимых кодонах генов KRAS и NRAS в опухолевой ткани. Эти молекулярные изменения характеризуют несколько механизмов развития колоректального рака, связанных с биологическими свойствами опухоли, прогнозом заболевания и чувствительностью к отдельным направлениям противоопухолевой терапии. Гены KRAS, NRAS и BRAF кодируют компоненты сигнального пути RAS-RAF-MAPK, регулирующего рост и пролиферацию клеток, а микросателлитная нестабильность возникает при нарушении системы MMR, отвечающей за исправление ошибок при копировании ДНК. Исследование проводится в опухолевой ткани из биопсийного или операционного материала, заключённого в парафиновый блок. Для определения входящих в панель молекулярных изменений используются фрагментный анализ и MLPA.

Состав исследования

• микросателлитная нестабильность (MSI);
• BRAF V600E;
• KRAS, кодоны 12, 13, 61, 117 и 146;
• NRAS, кодоны 12, 13, 61 и 117.

Клиническое значение

Мутации KRAS и NRAS изменяют работу белков RAS и поддерживают передачу пролиферативного сигнала независимо от блокирования рецептора EGFR. При метастатическом колоректальном раке активирующие мутации в исследуемых кодонах связаны с резистентностью к анти-EGFR-препаратам, включая цетуксимаб и панитумумаб. Определение мутационного статуса заявленных участков KRAS и NRAS используется при выборе системной терапии и позволяет выявить опухоли, для которых применение анти-EGFR-препаратов не обеспечивает ожидаемого терапевтического эффекта.
Мутация BRAF V600E приводит к постоянной активации белка BRAF и поддержанию сигнала по пути MAPK, способствующего росту и выживанию опухолевых клеток. При колоректальном раке она связана с характерными биологическими свойствами опухоли и неблагоприятным прогнозом при распространённом заболевании. BRAF V600E одновременно представляет терапевтическую мишень: её выявление при метастатическом колоректальном раке позволяет использовать схемы лечения, сочетающие ингибирование BRAF с блокадой EGFR.
Высокая микросателлитная нестабильность MSI-H характеризует опухоли с выраженным накоплением генетических изменений вследствие нарушения системы MMR. Образование большого количества опухолевых неоантигенов повышает иммуногенность таких новообразований и определяет их чувствительность к ингибиторам иммунных контрольных точек. Поэтому MSI-H/dMMR служит предиктивным биомаркером эффективности иммунотерапии при распространённом и метастатическом колоректальном раке.
При локализованном раке толстой кишки MSI-H/dMMR имеет прогностическое значение и учитывается при выборе послеоперационного лечения. Особенно важен этот показатель при II стадии заболевания, поскольку молекулярный статус опухоли изменяет оценку ожидаемой пользы адъювантной фторпиримидиновой терапии и дополняет данные о стадии и морфологических характеристиках опухоли.
Выявление MSI-H также позволяет определить колоректальные опухоли, связанные с нарушением системы MMR и требующие оценки возможного наследственного происхождения заболевания. При установленном дефиците MMR с потерей MLH1 наличие BRAF V600E характерно для спорадического пути развития опухоли и существенно снижает вероятность синдрома Линча. Сочетание данных MSI, MMR и BRAF используется для дальнейшего разграничения спорадических и наследственно обусловленных вариантов колоректального рака.

Что влияет на результат

Молекулярная гетерогенность колоректального рака может приводить к различиям между отдельными участками первичной опухоли и метастатическими очагами. В процессе прогрессирования заболевания и под воздействием противоопухолевой терапии меняется соотношение опухолевых клонов, поэтому материал, полученный из разных очагов или в разные периоды заболевания, может содержать различный набор определяемых мутаций. Наибольшее значение эта особенность приобретает при повторном молекулярном исследовании после проведённой системной терапии.