В структуре опухолей желудочно-кишечного тракта существует относительно редкая, но клинически значимая группа — гастроинтестинальные стромальные опухоли (GIST), составляющая 1-3% от всех гастроинтестинальных опухолей. Эти новообразования возникают из интерстициальных клеток Кахаля, которые выполняют функцию «пейсмейкеров» — регуляторов перистальтики. GIST могут локализоваться в любом отделе желудочно-кишечного тракта, но наиболее часто встречаются в желудке и тонкой кишке. В основе патогенеза GIST лежит мутационная активация генов, кодирующих рецепторы тирозинкиназ, преимущественно KIT и PDGFRA. Ген PDGFRA (platelet-derived growth factor receptor alpha) кодирует альфа-субъединицу рецептора, регулирующего пролиферацию и дифференцировку клеток под действием соответствующих лигандов. В норме рецептор активируется только в ответ на внешний сигнал (лиганд). Однако при мутациях в PDGFRA возникает лиганд-независимая конститутивная активация тирозинкиназной функции, что приводит к неконтролируемой клеточной пролиферации и формированию опухоли. Наиболее частой мутацией в PDGFRA, ассоциированной с GIST, является точечная мутация D842V в экзоне 18. Она приводит к резистентности опухоли к стандартной терапии иматинибом (ингибитором тирозинкиназ) и требует применения альтернативных препаратов.
Результат исследования имеет не только диагностическое, но и прогностическое и терапевтическое значение:
  Мутации в PDGFRA коррелируют с менее агрессивным поведением опухоли по сравнению с мутациями в гене KIT.
  PDGFRA-ассоциированные GIST чаще встречаются у мужчин, в желудке, имеют эпителиоидный гистологический вариант и медленное течение.
  Наличие D842V мутации требует назначения специфического ингибитора и предполагает резистентность к иматинибу, в отличие от большинства мутаций в KIT.

Молекулярное профилирование GIST позволяет:
  Точно установить тип мутации и дифференцировать опухоль от других мезенхимальных новообразований;
  Оценить прогностическую значимость — риск прогрессирования и метастазирования;
  Подобрать персонализированную таргетную терапию;
  Исключить или подтвердить показания к проведению адъювантного лечения после хирургического вмешательства.