Посев на анаэробную микрофлору и определение чувствительности к антибиотикам из различных локализаций

Анаэробные бактерии составляют часть нормальной микробиоты слизистых оболочек, особенно полости рта, кишечника и женских половых путей, но в тканях с нарушенным кровоснабжением, некрозом и низким содержанием кислорода эти же микроорганизмы становятся причиной гнойно-некротических инфекций. Наиболее клинически значимые анаэробы представлены Bacteroides и Parabacteroides , Prevotella, Porphyromonas, Fusobacterium , анаэробными грамположительными кокками, включая Finegoldia, Parvimonas и Peptostreptococcus , а также различными видами Clostridium . При повреждении слизистого или кожного барьера бактерии проникают в глубжележащие ткани, где ишемия, отёк, скопление экссудата и некротизированных тканей снижают доступ кислорода и создают условия для их размножения. Анаэробные инфекции поэтому особенно характерны для абсцессов, глубоких ран, некротических процессов и закрытых гнойных полостей; они часто сопровождаются выраженной болезненностью, отёком, гнойным отделяемым, некрозом, неприятным запахом и образованием газа в тканях. Во многих очагах анаэробы существуют вместе с аэробными и факультативно-анаэробными бактериями: последние потребляют кислород и дополнительно создают условия для роста облигатных анаэробов, поэтому глубокие гнойные инфекции нередко имеют полимикробный характер.

Посев проводят для выделения жизнеспособных анаэробных бактерий из отделяемого половых органов, раневого отделяемого, гноя и пункционной жидкости , после чего идентифицируют полученные культуры и определяют их чувствительность к антибиотикам. Клиническое значение результата напрямую зависит от источника материала. В отделяемом половых органов анаэробная флора обнаруживается и в норме, поэтому диагностическое значение приобретает её связь с признаками воспаления и конкретной локализацией. При восходящей инфекции женских половых путей анаэробы участвуют в эндометрите, сальпингите, тубоовариальных абсцессах и тазовом перитоните; Bacteroides fragilis и другие строгие анаэробы способны повреждать эпителий маточных труб и поддерживать деструктивное воспаление. В раневом отделяемом и гное посев особенно информативен при глубоких абсцессах, некротизирующих инфекциях, инфицированных укусах, хронических и плохо заживающих ранах, когда наряду с аэробами выявляются Bacteroides, Prevotella, Fusobacterium , анаэробные грамположительные кокки и Clostridium . 
Пункционная жидкость характеризует микрофлору непосредственно в глубоком очаге, поэтому выделение анаэроба из абсцесса, сустава или другой закрытой полости имеет значительно более прямое этиологическое значение, чем его обнаружение на поверхности слизистой или хронической раны. Для анаэробной инфекции особенно типична ситуация, когда в гное или при микроскопии видны бактерии и нейтрофильное воспаление, а обычный аэробный посев не даёт роста; это отражает присутствие микроорганизмов, которым для размножения необходимы бескислородные условия. Глубокий очаг также чаще даёт возможность выявить реальный состав полимикробной инфекции, поскольку поверхностное отделяемое дополнительно содержит бактерии, колонизирующие кожу и слизистые.

Определение чувствительности к антибиотикам необходимо потому, что устойчивость анаэробов неодинакова даже внутри близких групп. Представители Bacteroides fragilis group широко продуцируют β-лактамазы и поэтому устойчивы к пенициллину и ампициллину; у Prevotella, Fusobacterium и отдельных видов Clostridium также встречается β-лактамазная устойчивость, а чувствительность к клиндамицину существенно различается между видами и штаммами. Антибиотикограмма приобретает наибольшую клиническую ценность при тяжёлых инфекциях, выделении анаэроба из стерильной жидкости, отсутствии эффекта от начальной терапии, рецидиве инфекции и необходимости длительного лечения. В этих ситуациях видовая идентификация и профиль чувствительности позволяют учитывать свойства конкретного возбудителя, а не строить терапию только на ожидаемой активности препаратов против анаэробной флоры.