Для врача 
Посев кала на дисбактериоз с определением чувствительности к бактериофагам
Информация об исследовании
Микробиота кишечника участвует в переваривании пищи, обмене веществ, синтезе витаминов, поддержании защитных свойств слизистой оболочки и ограничении избыточного роста условно-патогенных бактерий и грибов. Нарушение соотношения основных представителей кишечной микрофлоры называют дисбактериозом. Оно проявляется снижением защитной флоры, изменением состава кишечной палочки, ростом условно-патогенных микроорганизмов и появлением грибковой пролиферации. Культуральное исследование кала определяет, какие бактерии и дрожжевые грибы выделяются при посеве и в каком количестве они присутствуют в образце. Результат выражают в КОЕ/г, то есть в колониеобразующих единицах на грамм материала. По этим данным оценивают соотношение облигатной флоры, типичной и изменённых форм Escherichia coli , условно-патогенных бактерий, грибов рода Candida и отдельных бактериальных возбудителей кишечных инфекций. Дисбиотические изменения часто сопровождаются нарушением стула, вздутием живота, урчанием, болями и дискомфортом в животе, непереносимостью отдельных продуктов, длительным восстановлением после кишечной инфекции или курса антибиотиков. Значение результата определяется не одной цифрой, а сочетанием показателей: снижением бифидофлоры и молочнокислых бактерий, изменением популяции E. coli , пролиферацией условно-патогенной флоры и ростом дрожжевых грибов. Определение чувствительности к бактериофагам дополняет посев, когда из образца выделена бактерия, для которой предусмотрены фаговые препараты. Бактериофаги являются вирусами бактерий и действуют избирательно на чувствительные бактериальные штаммы. Поэтому фагочувствительность определяют для конкретной выделенной культуры. При выделении шигелл или сальмонелл исследование дополняют определением чувствительности к антимикробным препаратам. Этот результат помогает врачу оценить активность препаратов против выявленного бактериального возбудителя кишечной инфекции.
Состав исследования
В исследовании оценивают основные культивируемые представители кишечной микрофлоры: бифидофлору, молочнокислые бактерии, типичную E. coli, гемолитическую E. coli , лактозонегативную E. coli , бактероиды, клостридии и энтерококки.
Отдельно определяют условно-патогенные микроорганизмы, включая представителей родов Citrobacter, Enterobacter, Klebsiella, Proteus, Morganella, Providencia, Pseudomonas, Serratia, Acinetobacter , а также стафилококки и другие бактерии, входящие в лабораторную панель. Для грибковой флоры оценивают Candida albicans и другие дрожжевые грибы рода Candida.
Панель также включает поиск отдельных бактериальных возбудителей кишечных инфекций: Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis , возбудителей сальмонеллёза и бактерий дизентерийной группы.
Чувствительность к бактериофагам определяют для отдельных видов Klebsiella , Escherichia coli , Proteus , Pseudomonas aeruginosa , стафилококков, стрептококков, энтерококков, сальмонелл и шигелл. В зависимости от вида бактерии используют колипротейный, клебсиеллёзный поливалентный, стафилококковый, стрептококковый, синегнойный, сальмонеллёзный или дизентерийный бактериофаг, а также комплексные препараты: Интести-бактериофаг, Пиобактериофаг комплексный и Секстафаг.
Чувствительность к антимикробным препаратам определяют при выделении шигелл или сальмонелл. Для шигелл максимально возможный набор включает цефотаксим, хлорамфеникол, ампициллин, ко-тримоксазол и ципрофлоксацин. Для Salmonella spp. максимально возможный набор включает цефотаксим, хлорамфеникол, ампициллин и ко-тримоксазол.
Клиническое значение
Бифидобактерии и молочнокислые бактерии поддерживают защитные свойства кишечной среды, участвуют в метаболизме углеводов, подавляют избыточный рост условно-патогенных микроорганизмов и помогают сохранять устойчивость микробиоценоза. Их снижение характерно для дисбиотических изменений после антибактериальной терапии, кишечных инфекций, нарушений питания и состояний, сопровождающихся ослаблением колонизационной резистентности кишечника.
Escherichia coli оценивают по нескольким показателям. Типичная E. coli относится к обычной кишечной флоре. Лактозонегативная E. coli отличается изменённой ферментативной активностью; её увеличение отражает перестройку популяции кишечной палочки. Гемолитическая E. coli в норме отсутствует; её обнаружение усиливает значение результата при диарее, болях в животе, вздутии и других кишечных жалобах. Пролиферация условно-патогенных бактерий показывает избыточный рост микроорганизмов, которые при высоком количестве участвуют в поддержании брожения, газообразования, раздражения слизистой оболочки и нарушений стула. Наибольшее значение имеет сочетание такой пролиферации со снижением бифидофлоры, молочнокислых бактерий или изменением состава E. coli .
Энтерококки, бактероиды и клостридии входят в состав оцениваемой кишечной флоры и имеют количественные референсные значения. Их результат рассматривают в общей структуре посева, вместе с облигатной флорой, кишечной палочкой, условно-патогенными бактериями и грибами.
Избыточный рост грибов рода Candida имеет значение при вздутии, нестабильном стуле, дискомфорте в животе, а также после антибиотикотерапии, при иммунодефицитных состояниях, сахарном диабете, химиотерапии и других состояниях, нарушающих микробное равновесие.
Обнаружение сальмонелл, бактерий дизентерийной группы или патогенных иерсиний указывает на бактериальную кишечную инфекцию. Такие находки оценивают отдельно от дисбиотических изменений, поскольку они связаны с конкретным инфекционным возбудителем. При выделении шигелл или сальмонелл результат дополняют антибиотикограммой.
Фагочувствительность показывает, какие бактериофаги активны против выделенного штамма. Результат указывают для конкретного микроорганизма и конкретного фагового препарата. Если для выделенной бактерии фаговые препараты в лабораторной панели не предусмотрены, чувствительность к бактериофагам не определяется.
Что влияет на результат анализа
На результат влияют антибиотики, бактериофаги, пробиотики, противогрибковые препараты, химиотерапия и лучевая терапия. Эти факторы изменяют количество жизнеспособных бактерий и грибов, выделяемых при посеве, поэтому сроки сдачи анализа согласуют с назначением врача и правилами лаборатории. Слабительные препараты, клизмы, ректальные свечи и диагностические процедуры с введением контрастных веществ меняют состав материала и искажают количественный результат. Для посева важно сохранить жизнеспособность микроорганизмов. Нарушение сроков доставки, неправильная температура хранения и высыхание материала приводят к снижению количества бактерий, особенно чувствительных к условиям внешней среды. Результаты повторных исследований сравнивают при одинаковых условиях подготовки, сбора и доставки материала. Питание, перенесённые инфекции и начатое лечение меняют состав выделяемой микрофлоры и приводят к отличиям между бланками.
Когда назначают анализ
- Исследование назначают при длительных или повторяющихся нарушениях стула, вздутии живота, урчании, болях и дискомфорте в животе, неустойчивом стуле, чередовании диареи и запоров, а также при сохраняющихся кишечных жалобах после перенесённой кишечной инфекции.
- Анализ проводят после антибактериальной терапии, лечения бактериофагами или других воздействий, способных изменить состав кишечной микрофлоры, когда требуется оценить восстановление бифидофлоры, молочнокислых бактерий, типичной Escherichia coli и выявить возможную пролиферацию условно-патогенных микроорганизмов.
- Исследование используют при хронических заболеваниях желудочно-кишечного тракта, нарушениях пищеварения, синдроме мальабсорбции, пищевой непереносимости, аллергических заболеваниях, иммунодефицитных состояниях, а также у пациентов, получающих длительную гормональную, противоопухолевую или лучевую терапию.
- У детей анализ назначают при стойких диспептических нарушениях, нарушениях питания, недостаточной прибавке массы тела, частых кишечных расстройствах, аллергическом дерматите и неблагоприятном восстановлении микрофлоры после инфекций или антибактериального лечения.
- Исследование показано при подозрении на избыточный рост условно-патогенных бактерий или грибов рода Candida , особенно при сочетании кишечных симптомов с факторами риска дисбиотических изменений.
- Анализ также назначают при необходимости определить чувствительность выделенных бактерий к бактериофагам. При выявлении шигелл или сальмонелл дополнительно проводят определение чувствительности к антимикробным препаратам.
Как подготовиться к анализу
- Материал собирают до начала лечения антибиотиками, бактериофагами, пробиотиками, противогрибковыми препаратами и другими средствами, влияющими на кишечную микрофлору. Если лечение уже проводилось, срок сдачи анализа определяют по назначению врача и правилам лаборатории.
- Перед сбором кала не используют слабительные препараты, клизмы, ректальные свечи и другие средства, изменяющие состав материала. После рентгенологических исследований с контрастным веществом анализ сдают в срок, рекомендованный лабораторией.
- Кал собирают после самостоятельной дефекации в стерильный контейнер. Материал не должен контактировать с водой из унитаза, мочой, моющими и дезинфицирующими средствами. Для сбора используют чистую сухую ёмкость или специальное приспособление, затем небольшое количество кала переносят в контейнер.
- Образец берут из разных участков кала. При неоднородной консистенции, наличии слизи или изменённых фрагментов эти участки включают в материал для исследования.
- Контейнер плотно закрывают, маркируют и доставляют в лабораторию в установленный срок. Для культурального исследования важно сохранить жизнеспособность бактерий и грибов, поэтому нельзя допускать высыхания материала, перегрева, замораживания и длительного хранения без транспортной среды.
- Для повторного исследования желательно соблюдать те же условия подготовки, сбора и доставки материала. Это позволяет корректно сравнивать количественные изменения микрофлоры в динамике.
Что означают результаты
В бланке результата для каждого микроорганизма указывают его количество, референсные значения и лабораторную оценку. Количество выражают в КОЕ/г. Возможные варианты интерпретации включают значения «в пределах нормы», «снижено», «пролиферация» и «не обнаружено».
К основным показателям микробиоценоза относятся бифидофлора, молочнокислые бактерии, типичная Escherichia coli , гемолитическая Escherichia coli , лактозонегативная Escherichia coli , бактероиды, клостридии и энтерококки. Эти показатели отражают состояние основных культивируемых представителей кишечной флоры и позволяют оценить, сохранены ли защитные группы микроорганизмов, изменён ли состав кишечной палочки и есть ли количественное смещение отдельных бактериальных групп.
Отдельный блок бланка посвящён условно-патогенной флоре. В него входят Citrobacter freundii, Citrobacter koseri, Enterobacter cloacae, Enterobacter aerogenes, Enterobacter sakazakii, Pantoea agglomerans, Edwardsiella tarda, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Hafnia alvei, Proteus myxofaciens, Proteus mirabilis, Proteus vulgaris, Morganella morganii, Providencia rettgeri, Pseudomonas stutzeri, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas putida, Raoultella ornithinolytica, Serratia marcescens, Acinetobacter baumannii, Acinetobacter lwoffii и Alcaligenes faecalis . Их пролиферация приобретает наибольшее значение при сочетании со снижением бифидофлоры, молочнокислых бактерий или изменением состава E. coli.
Грамположительная условно-патогенная флора представлена Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus haemolyticus и Staphylococcus aureus . Дрожжевые грибы оценивают по показателям Candida albicans и других грибов рода Candida . В пределах референсных значений эти микроорганизмы не рассматривают как самостоятельное объяснение кишечных симптомов; значение имеет их избыточный рост и сочетание с другими отклонениями.
Бланк также включает поиск отдельных бактериальных возбудителей кишечных инфекций: Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis, возбудителей сальмонеллёза и бактерий дизентерийной группы. Их обнаружение оценивают отдельно от дисбиотических изменений, поскольку в этом случае результат указывает на возможную бактериальную кишечную инфекцию.
В разделе «прочие» могут быть указаны дополнительные микроорганизмы, выделенные при посеве, но не включённые в основной перечень показателей. Их значение определяют по количеству, виду микроорганизма и сочетанию с остальными результатами. Если для такого микроорганизма не предусмотрены бактериофаги, лаборатория указывает это отдельным комментарием.
Лабораторные признаки дисбиотических изменений формируются из сочетаний показателей. К ним относят увеличение количества одного или нескольких условно-патогенных микроорганизмов при сохранённом количестве бифидобактерий; увеличение условно-патогенной флоры при умеренном снижении бифидобактерий; снижение бифидобактерий и/или молочнокислых бактерий без пролиферации условно-патогенной флоры; выраженное снижение бифидобактерий в сочетании с уменьшением молочнокислых бактерий, появлением изменённых форм E. coli и высоким количеством условно-патогенных микроорганизмов.
Чувствительность к бактериофагам определяют для выделенных бактерий, входящих в лабораторный перечень. Фагочувствительность предусмотрена для Klebsiella pneumoniae, Klebsiella rhinoscleromatis, Klebsiella ozaenae, Klebsiella oxytoca, Staphylococcus aureus, других стафилококков, стрептококков, энтерококков, Pseudomonas aeruginosa, Proteus vulgaris, Proteus mirabilis, Escherichia coli, сальмонелл серогрупп A, B, C, D, E, Shigella sonnei и предусмотренных серотипов Shigella flexneri . В зависимости от вида бактерии используют колипротейный, клебсиеллёзный поливалентный, стафилококковый, стрептококковый, синегнойный, сальмонеллёзный или дизентерийный бактериофаг, а также комплексные препараты: Интести-бактериофаг, Пиобактериофаг комплексный и Секстафаг.
Если выделенная бактерия отсутствует в перечне микроорганизмов, для которых предусмотрены фаговые препараты, чувствительность к бактериофагам не определяется. В бланке это отражают отдельным комментарием, как при выделении Citrobacter braakii.
Антибиотикограмму выполняют при выделении шигелл или сальмонелл. Для шигелл максимально возможный набор включает цефотаксим, хлорамфеникол, ампициллин, ко-тримоксазол и ципрофлоксацин. Для Salmonella spp. максимально возможный набор включает цефотаксим, хлорамфеникол, ампициллин и ко-тримоксазол.
Стоимость исследования
биоматериала 0 ₽