Исследование микрофлоры кишечника культуральным методом (дисбактериоз)

Кишечная микробиота представляет собой сообщество микроорганизмов, постоянно населяющих пищеварительный тракт и участвующих в переработке пищевых субстратов, образовании ряда метаболитов, поддержании защитных свойств слизистой и устойчивости кишечника к колонизации патогенными бактериями. Состав этого сообщества неоднороден и зависит от возраста, питания, состояния кишечника и лекарственных воздействий. Культуральное исследование кала определяет количество жизнеспособных бактерий и грибов, способных расти в предусмотренных условиях, и позволяет сопоставить содержание отдельных представителей микрофлоры с возрастными референсными значениями. Результат показывает количественные изменения исследуемых групп микроорганизмов, избыточный рост отдельных условно-патогенных бактерий и наличие ряда кишечных патогенов. В лабораторном бланке результаты для количественно определяемых микроорганизмов представлены с указанием референсных диапазонов и их оценки с учётом возраста.

Состав исследования

В исследование входят бифидобактерии, молочнокислые бактерии, типичная, гемолитическая и лактозонегативная Escherichia coli , бактероиды, клостридии и энтерококки. Отдельно определяется широкий спектр условно-патогенных микроорганизмов, включая представителей Citrobacter, Enterobacter, Klebsiella, Proteus, Morganella, Providencia, Pseudomonas, Acinetobacter, Staphylococcus и дрожжевые грибы рода Candida . Также оценивается наличие Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis , возбудителей сальмонеллёза и бактерий дизентерийной группы.

Клиническое значение

При изменениях стула, вздутии живота, дискомфорте и других кишечных симптомах исследование позволяет определить количественное соотношение отдельных групп культивируемой микрофлоры и выявить выраженные отклонения от возрастных референсных значений. Снижение содержания бифидобактерий, молочнокислых бактерий, типичной E. coli или энтерококков характеризует уменьшение их представительства в исследуемом образце, тогда как увеличение отдельных условно-патогенных микроорганизмов указывает на их избыточный рост. Такие изменения оценивают в совокупности, поскольку отклонение одного показателя не устанавливает причину кишечных симптомов и не характеризует состояние микробиоты целиком. 
Условно-патогенные бактерии способны присутствовать в кишечнике без клинических проявлений, поэтому их обнаружение само по себе не означает инфекционное заболевание. Диагностическая оценка зависит от количества выделенного микроорганизма, сочетания с другими изменениями микрофлоры и клинической картины. Это особенно важно для энтеробактерий, стафилококков, неферментирующих грамотрицательных бактерий и грибов рода Candida , для которых количественное превышение референсного уровня имеет иное значение, чем простое присутствие в образце. В представленном бланке для большинства таких микроорганизмов установлен количественный порог, ниже которого результат относится к референсному диапазону. 
Выявление кишечных патогенов интерпретируется отдельно от количественных изменений обычной микрофлоры. Для Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis , возбудителей сальмонеллёза и бактерий дизентерийной группы референсным результатом является отсутствие микроорганизма. Их обнаружение указывает на присутствие соответствующего инфекционного агента в исследуемом материале и требует сопоставления с симптомами острой или затяжной кишечной инфекции. 
Культуральное исследование характеризует только те микроорганизмы, которые входят в состав панели и способны расти в используемых условиях. Поэтому нормальные значения исследуемых показателей не исключают изменений других представителей кишечной микробиоты, которые данным анализом не определяются. Эта особенность особенно важна при интерпретации результата как характеристики конкретного набора культивируемых микроорганизмов, а не всего кишечного микробного сообщества.

Что влияет на результат

Антибактериальные препараты и кишечные антисептики подавляют чувствительные к ним микроорганизмы и снижают их количество в посеве, одновременно изменяя соотношение остальных представителей культивируемой микрофлоры. Пробиотики способны повышать количество микроорганизмов, соответствующих входящим в их состав штаммам, и тем самым изменять количественную картину исследования. Слабительные препараты и интенсивная подготовка кишечника ускоряют выведение содержимого и уменьшают время контакта микроорганизмов с кишечной средой, поэтому количественное соотношение бактерий в кале после такого воздействия способно отличаться от обычного состояния.