Исследование микробиоценоза кишечника (дисбактериоз) культуральными методами

Культуральное исследование оценивает количественный и качественный состав микрофлоры кала путём посева биоматериала на питательные среды с последующей идентификацией выросших колоний. Метод позволяет выявить представителей облигатной флоры (бифидобактерии, лактобактерии, кишечная палочка), факультативной и условно-патогенной флоры (стафилококки, клебсиеллы, протей, грибы рода Candida), а также патогенные энтеробактерии. Результат отражает соотношение групп микроорганизмов, что используется для характеристики микробиоценоза кишечника.

Поводом для назначения культурального исследования микробиоценоза кишечника обычно служат длительные нарушения стула, метеоризм, боли в животе, кожные проявления неясного генеза, состояния после антибактериальной терапии, кишечные инфекции в анамнезе. Клиническую целесообразность определяет гастроэнтеролог, инфекционист или педиатр с учётом анамнеза, симптоматики и сопутствующих заболеваний. Результат посева рассматривается совместно с клинической картиной и данными других исследований кишечника.

Культуральный метод основан на выращивании живых микроорганизмов на питательных средах, тогда как ПЦР-диагностика выявляет фрагменты ДНК бактерий независимо от их жизнеспособности. Посев позволяет получить изолят для последующего определения чувствительности к антибактериальным препаратам и бактериофагам, что недоступно при молекулярном исследовании. ПЦР-методики охватывают более широкий спектр некультивируемых форм, но не дают возможности оценить функциональную активность выделенных штаммов. Методы рассматриваются как взаимодополняющие в диагностическом алгоритме.

Результат культурального исследования сам по себе не служит самостоятельным критерием постановки диагноза, поскольку понятие «дисбактериоз» не относится к самостоятельным нозологическим единицам согласно действующим клиническим рекомендациям. Изменение состава микрофлоры кала совместимо с различными состояниями — от транзиторных нарушений после кишечной инфекции до хронических заболеваний желудочно-кишечного тракта. Интерпретация проводится лечащим врачом с учётом симптомов, анамнеза, данных эндоскопических и лабораторных исследований.

Спектр выявляемых микроорганизмов включает облигатную анаэробную флору (бифидобактерии, лактобактерии, бактероиды), типичную и атипичную кишечную палочку, энтерококки, условно-патогенные энтеробактерии (клебсиелла, протей, энтеробактер, цитробактер), неферментирующие грамотрицательные бактерии, стафилококки (включая золотистый), стрептококки, дрожжеподобные грибы рода Candida. Дополнительно оценивается наличие патогенных энтеробактерий — сальмонелл и шигелл. Для выделенных условно-патогенных культур обычно определяется чувствительность к антибактериальным препаратам и бактериофагам.

Длительность культурального исследования микробиоценоза кишечника обусловлена биологическими особенностями метода: для роста колоний на питательных средах, их идентификации и количественного учёта требуется несколько суток инкубации. Конкретный срок выполнения по данному тесту указан в карточке исследования и может включать дополнительное время при необходимости определения чувствительности выделенных штаммов к антибактериальным препаратам и бактериофагам.