Как любой продукт растительного происхождения, овес содержит термолабильные аллергенные белки, которые при длительной обработке могут распадаться, однако не полностью. Овсяная каша быстрого приготовления, которая не требует длительной варки, а только заваривания небезопасна для аллергиков. Аллергические реакции также могут возникать при употреблении в пищу хлебобулочных изделий из овсяной муки, печенья, батончиков-мюсли. Овес имеет перекрестную реактивность с пыльцой других злаковых, а также мятликовых и луговых трав. Именно поэтому у людей в сезон пыления злаков и мятликов, при употреблении в пищу продуктов из овса нередко возникают аллергические реакции. Если после употребления в пищу овса, продуктов из овса появляются аллергические реакции, рекомендуется выполнить анализ на определение уровня аллергенспецифических IgE к овсу. Анализ выполняется с помощью методики ImmunoCAP (Иммунофлюоресценция на трёхмерной пористой твёрдой фазе, Phadia 250, Phadia)