Бокаловидные клетки кишечника (БКК) вырабатывают слизь, которая защищает слизистую кишки от агрессивных факторов ее содержимого. Клетки обнаруживаются во всех отделах кишечника, однако их число максимально в прямой кишке, особенно в криптах толстого кишечника. Основным антигеном БКК являются муцины — молекулы, состоящие из белка и углеводов. Наличие антител к БКК тесно связано с воспалительными заболеваниями кишечника. Антитела к БКК часто отмечаются у пациентов с неспецифическим язвенным колитом (15-40%), редко встречаются при болезни Крона, других органспецифических заболеваниях и очень редко у здоровых лиц. Также антитела к БКК могут встречаться при аутоиммунной энтеропатии — редком состоянии, которое связано со снижением числа бокаловидных клеток, виллезной атрофией и воспалением в тонком кишечнике.