Пепсиноген II —белок предшественник пепсина, обеспечивает переваривание белков, специфический маркер Helicobacter pylori-ассоциированного гастрита, язвенного поражения желудка и двенадцатиперстной перстной кишки, канцероматозного процесса. Пепсиноген II обнаруживается в антральной части желудка, в проксимальной части двенадцатиперстной кишки, в пилорических железах и железах Бруннера.Концентрация пепсиногена II является индикатором структурного и физиологического состояния слизистой оболочки желудка. Соотношение пепсиногена I и пепсиногена II в сыворотке крови здорового человека составляет примерно 4:1. Его соотношение линейно уменьшается с увеличением степени тяжести атрофического гастрита. Отношение <2,5 является маркером атрофического гастрита. Увеличение уровня пепсиногена II может свидетельствовать об остром или хроническом гастрите, синдроме Золлингера-Эллисона. Снижение пепсиногена II наблюдается после оперативных вмешательств (резекция желудка, ваготомия), также при болезни Аддисона, микседеме.