Анализ перестроек гена PDGFRB (FISH, колич.)

Исследование выявляет перестройки гена PDGFRB, расположенного в области 5q32 и кодирующего рецептор β тромбоцитарного фактора роста (PDGFRβ). Этот рецептор относится к тирозинкиназам и участвует в передаче сигналов, регулирующих рост и деление клеток. При хромосомной перестройке PDGFRB может соединяться с другим геном, в результате чего образуется химерная тирозинкиназа с постоянной активностью, поддерживающая неконтролируемое размножение патологических кроветворных клеток. Такие изменения относятся к драйверным генетическим событиям и встречаются при отдельных миелоидных и лимфоидных неоплазиях, нередко сопровождающихся стойкой эозинофилией. Исследование проводится методом FISH с break-apart-пробой к локусу PDGFRB. Такая проба фиксирует нарушение целостности исследуемого локуса и позволяет обнаружить перестройку независимо от того, с каким геном произошло слияние. Анализ выполняют в интерфазных ядрах клеток цельной крови, а результат отражает долю клеток, в которых выявлен аномальный сигнальный паттерн. Одним из наиболее известных генетических вариантов является ETV6::PDGFRB, возникающий при транслокации t(5;12), однако число возможных генов-партнёров значительно больше, поэтому поисковый FISH-анализ особенно полезен в ситуациях, когда конкретный вариант слияния заранее неизвестен.

Клиническое значение

Перестройки PDGFRB обнаруживаются при группе миелоидных и лимфоидных неоплазий с тирозинкиназными генными слияниями. Заболевание может проявляться как миелопролиферативная или миелодиспластическая/миелопролиферативная неоплазия, хронический миеломоноцитарный лейкозоподобный процесс, острый миелоидный лейкоз или значительно реже лимфобластная неоплазия. Характерным лабораторным признаком часто становится увеличение количества эозинофилов, поэтому исследование особенно информативно при стойкой необъяснимой эозинофилии в сочетании с признаками клонального заболевания крови. Выявление перестройки PDGFRB позволяет отнести заболевание к генетически определённой группе, отделить его от других миелоидных неоплазий со сходной морфологической и гематологической картиной и направить дальнейшее обследование на точную характеристику выявленного генного слияния. Положительный результат имеет непосредственное значение для выбора терапии , поскольку химерные белки с участием PDGFRB обычно сохраняют тирозинкиназную активность, чувствительную к ингибиторам тирозинкиназ. Для PDGFRB-перестроенных неоплазий особенно выражена чувствительность к иматинибу , и выявление такой перестройки может принципиально изменить лечебную стратегию даже при агрессивной или необычной клинической картине заболевания. После обнаружения перестройки методом FISH могут выполняться дополнительные молекулярно-генетические исследования для определения гена-партнёра и точного строения химерного транскрипта, что уточняет генетическую характеристику опухоли и при наличии подходящего молекулярного маркера позволяет использовать более чувствительные методы для последующего наблюдения. 
Количественный FISH-результат показывает долю исследованных клеточных ядер с перестройкой PDGFRB , поэтому при повторном исследовании может использоваться для оценки изменения представленности цитогенетически определяемого клона. Снижение или исчезновение FISH-положительных клеток на фоне лечения соответствует уменьшению клона, тогда как его сохранение или повторное появление требует сопоставления с клиническими, гематологическими и молекулярными данными. Если конкретный химерный транскрипт уже установлен, для высокочувствительного контроля заболевания обычно предпочтительны молекулярные методы, способные выявлять значительно меньший объём остаточного клона.

Отрицательный результат означает, что перестройка локуса PDGFRB не обнаружена в исследованных клетках в пределах чувствительности FISH-метода . При сохраняющемся подозрении на клональную миелоидную или лимфоидную неоплазию исследование может дополняться поиском других генетических нарушений, включая перестройки PDGFRA, FGFR1, JAK2 и другие тирозинкиназные слияния, поскольку сходный клинический и гематологический фенотип может формироваться при различных драйверных изменениях.

Что влияет на результат

Информативность исследования зависит прежде всего от доли патологического клона в образце и качества интерфазных ядер. Если клетки с перестройкой PDGFRB представлены в периферической крови в небольшом количестве, их доля может оказаться ниже аналитического порога метода, поэтому результат сопоставляют с общим анализом крови, клеточным составом костного мозга и другими данными гематологического обследования. Предшествующая противоопухолевая или таргетная терапия может существенно уменьшать количество клеток с перестройкой PDGFRB и соответственно изменять количественный FISH-результат. При повторных исследованиях важно учитывать, получен образец до начала лечения, на фоне терапии, в ремиссии или при подозрении на рецидив, поскольку анализ отражает представленность патологического клона на момент взятия материала.